本病诊断有赖于病原体的分离及血清学的检查，基因诊断对于确立该病十分重要。
1、补体结合试验 是本病重要的血清学诊断方法，能检测两种抗体：沙眼衣原体抗体和鹦鹉热衣原体抗体。因为人群中常见有衣原体感染，所以本试验阳性有助于诊断，但不能靠其结果决定诊断。患者血清滴度高，多为1:64或以上，而结膜炎砂眼衣原体感染时血清滴度低(1:16—1:32)。一般而言，本试验血清滴度1:8或1:6对本病诊断有提示意义，而1:64或以上则有诊断意义。恢复期患者血清滴度降低。此外，血清试验的结果不完全与抗生素治疗反应相平行。
2、病原体培养 宜取肿大的淋巴结穿刺物接种在鸡胚卵黄囊，或做组织(细胞)培养或小白鼠颅内接种。阳性者有诊断价值。另需做细菌培养和涂片革兰氏染色，以除外葡萄球菌或其他细菌所致的淋巴结炎症。
3、微量免疫荧光试验 能检测不同血清型衣原体特异性抗体，比补体结合试验更为敏感和特异，但因试验条件的限制，目前尚难以广泛应用。
4、活体组织检查 取皮肤、黏膜损害或淋巴结制成切片，观察其病理变化，对诊断有提示意义。
5、基因诊断。
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