一、输精管先天性异常
输精管先天性异常比较罕见，主要有如下4类畸形。
1、输精管缺如
这种畸形相对多些。据统计，在无精子症患者中1%-10%有输精管缺如。可为单侧或双侧缺如，输精管缺如常合并附睾发育不全或缺如，亦可有精囊、射精管、输尿管甚至膀胱三角区完全缺如，但输精管缺如不一定意味着睾丸缺如，因为两者胚胎来源各异。有报道显示输精管先天性缺如患者出生时父母年龄越大，越靠近末位者，发生输精管先天性缺如机会越多。双侧输精管缺如时，当然生殖能力亦丧失。
2、输精管发育不全 输精管存在，但发育不全，输精管全部或部分长得纤细、或闭锁不通，其病理表现为输精管严重纤维化及组织结构发育不良。病人往往因不育症诊治而发现。
3、输精管异位
有一侧或双侧输精管异位，位置偏离精索或开口异常，还可合并其他泌尿生殖器官畸形。
4、重复输精管
较罕见，临床一般无症状，往往在绝育手术后发生再孕，在追述再孕原因时才被发现。因此，在男性绝育中必须仔细检查，若有重复输精管，应分别结扎。双侧输精管先天性畸形，一般是没有生育力的。重复输精管和输精管缺如的患者身体发育及双侧睾丸均正常，性生活、射精及精液量亦可无异常。
二、输精管炎
输精管炎指输精管的感染性疾病，好发于青少年，可单发，也可双侧同时受累。单纯输精管炎少见，常与附睾炎同时存在，可以是一般普通细菌的非特异性感染，也可以是特异性病原体感染，如结核性、淋病性等。本病分急性输精管炎和慢性输精管炎两大类。由于炎症改变可导致输精管阻塞，引起继发性不育症。
三、输精管肿瘤
输精管肿瘤颇为罕见，多半与附睾肿瘤同时发生，或者由附睾肿瘤蔓延浸润而成，其诊断和处理方法与附睾肿瘤相同。
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